后于谦入朝，推荐参政王来、孙原贞，通政使李锡逢迎王振的指使，弹劾于谦因为长期未得晋升而心生不满，擅自推举人代替自己，把他投到司法部门判处死刑，关在狱中三个月。
后来百姓听说于谦被判处死刑，一时间群民共愤，联名上书，王振便编了个理由给自己下台，称从前也有个名叫于谦的人和他有恩怨，说是把那个“于谦”和被关起来的于谦搞错了，才把于谦放出来，降职为大理寺少卿，后囚山西。
山西、河南的官吏和百姓俯伏在宫门前上书，请求于谦留任的人数以千计，周王、晋王等藩王也这样上言，于是再命于谦为巡抚。
当时的山东、陕西流民到河南求食的，有二十余万人，于谦请求发放河南、怀庆两府积储的粟米救济。
又奏请令布政使年富安抚召集这些人，给他们田、牛和种子，由里老监督管理，前后在任共十九年，他父母去世时，都让他回去办理丧事，不久便起用原职。
公元年，于谦被召回京，任兵部左侍郎，而他最脍炙人口的事迹也正式拉开帷幕。
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