统一蒙古的各个部落的伟大史实，最终由成吉思汗成就了。在他以前，他的祖先也曾多次尝试过。有几次，他们已接近成功了，可惜，紧接着各部落又分道扬镳了。于是，整个蒙古又陷入部落分散、各自为政、族间残酷仇杀、混乱无序和软弱无能的状态。当此之时，在世界上的人们中，要数这些狼与鹿的子孙们的生活最为悲惨了。
孛端察儿蒙合里之孙蔑年土敦年纪不大就去世了，留下了七个儿子。蒙古家系学者们依次记下了这七个儿子的姓名。蔑年土敦的长子名叫合赤曲鲁克，第七个儿子叫纳臣把阿秃儿。蔑年土教逝世后，他的遗孀那莫伦暂继之为部落的首领。那莫伦是这样一类蒙古女人在部落政权更替的过渡时期，她们能用男人般有力的大手高举起部落的大旗，号令整个部落。
纳臣把阿秃儿生有二子，分别为兀鲁兀歹、忙忽台，后来成为兀鲁兀惕氏、忙忽惕氏的始祖。纳臣把阿秃儿的原配妻子后来还生有两个儿子，一名为失主兀歹，一名为朵豁剌歹。
朵豁剌歹建立了著名的蒙古朵豁剌剔部，后来成为蒙古土尔扈特部落的核心。
宋宁宗赵扩开禧三年(元太祖二年，公元1207年)，成吉思汗派长子术赤征服了林中百姓后，将斡亦剌惕部归忽都合别乞管辖。成吉思汗后与斡亦剌惕部建立了世袭的姻亲关系。土尔扈特部落的贵族们以此为荣，他们的地位相应地发生了变化，因此也成了林中百姓的协同征服者，伺候受到了成吉思汗的许多嘉奖和赏赐，人民生活也相应发生变化，在历史上仍然称斡亦剌惕部或客列亦惕部。
宋嘉定十年(元太祖十二年，公元1217年)，成吉思汗再次派术赤镇压了秃马惕部叛乱后，土尔扈特部落的牧区扩展到秃马惕故地乞儿吉思地区(今俄罗斯中西伯利亚高原西侧叶尼塞河上游)。随着成吉思汗的西征，并收复新疆，作为黄金家族属民的土尔扈特部落，开始扩散到天山南北和中亚各地参加征战。
宋嘉定十一年(元太祖十三年，公元1218年)，土尔扈特部落被蒙古大汗将军哲别所召，参加征讨屈出律军队的战斗，大败屈出律的军队于塔里木盆地南部巴达哈桑山中，天山南麓喀什噶尔、鸭儿看、和田诸城依次而下。迄此天山南北各地皆归蒙古汗，新疆割据纷争的局面才宣告结束，也为元、明两代成吉思汗的后代统治天山南北各地打下了基础。
宋理宗赵昀景定元年(元世祖元年，公元1260年)，成吉思汗的孙子薛禅汗孛儿只斤·忽必烈借助内地汉族地主的强大势力，在开平夺取了蒙古汗国的大汗位，这引起出也是身于黄金家族而又是卫拉特部落的脱勒劣赤女婿阿里不哥的不满。在土尔扈特部落和其它卫拉特部落的支持下，孛儿只斤·阿里不哥在合剌合林也被拥立为大汗。经过四年的战争，孛儿只斤·阿里不哥遭到了惨败，撤退到伊犁河流域。随之，支持孛儿只斤·阿里不哥的土尔扈特部落和其它卫拉特部落，又一次离开八河流域迁徙到察合台汗国境内。
宋景定五年(元世祖至元元年，公元1264年)，孛儿只斤·阿里不哥和支持他的土尔扈特和其它卫拉特各部走投无路，向元世祖投降。当时的土尔扈特部落和其它卫拉特部落虽然已经强大起来，但是受到传统正统观念的影响，没有去争夺蒙古大汗的汗位。而在东蒙古的黄金家族的其他封建主们纷纷去争夺蒙古大汗位时，土尔扈特部落和其它卫拉特部落却支持出身黄金家族的阿里不哥去争夺大汗汗位。因为不管西蒙古封建主军事势力强大到何种程度，除了黄金家族的大元后裔之外，均不可能自己成为东蒙古本土的汗。尽管孛儿只斤·阿里不哥酗酒无度，指挥无方，刚愎自用，屡战屡败，也只得支持这位和卫拉特各部有亲缘关系的大元后裔，甚至导致卫拉特各部大撤退和向元世祖投降也在所不惜。
大元帝国又一次统一了土尔扈特等部落及卫拉特各部落之后，让卫拉特斡亦剌惕的首领做被奴役部落的管理者，管辖属地的部众及领地外，还在谦河一带设置万户府，由黄金家族的子孙担任万户长。元朝至元七年(公元1270年)，元世祖得悉土尔扈特部落及卫拉特各部管理秩序较为混乱，万户府内花天酒地，酗酒无度，斡亦剌惕部管理者敷衍了事，不负责任，造成尾大不掉之势。元世祖果断派保定府汉人刘好礼为叶尼塞河上游吉里吉思五部断事官，管理卫拉特各部。刘好礼团结土尔扈特部落和其它卫拉特部落的头领，大胆革除各类弊政，认真审查了多年余积的各种民事刑事案件，并任用土尔扈特部落的王罕之孙阿木胡兰